เมื่อสงครามฮงไคได้สิ้นสุดลงด้วยการที่เคียน่านำเอาพลังงานฮงไคไปผนึกบนดวงจันทร์ โดยในขณะเดียวกันเหล่าวีรชนในอดีตทั้ง 13 คน เมื่อนานมาแล้วได้โอกาสครั้งใหม่ ณ นอกระบบสุริยในฐานะของผู้บุกเบิกครั้งแรก

เมื่ออดีตมือสังหารของ SAO ที่ได้ไปก่อคดีในเกม GGO ได้พลาดท่าในศึกที่ต้องต่อสู้กับคิริโตะจนพอรู้ตัวอีกทีก็มาอยู่ในโลกที่ไม่รู้จักแล้วก็ต้องมาทำภารกิจจำเป็นพร้อมกับสืบหาความจริงไปพร้อมกัน