เมื่อโลกถูกคุกคามโดยปัญญาประดิษฐ์ที่เคยถูกสร้างขึ้นมาเพื่อปกป้องมนุษยชาติจากภัยนอกโลก ทีมแบล็คฮอว์คต้องเผชิญหน้ากับโพรโตคอลX ในสงครามจักรกลที่ดุเดือดและไม่มีวันสิ้นสุด เพื่อต่อสู้และยับยั้งแผนการกบฏ

ในยุคที่โลกยังคงอยู่ภายใต้การปกครองของเทพเจ้า ผู้ดูแลรักษาสมดุลแห่งธรรมชาติและมนุษย์ แต่เมื่อพลังมืดเริ่มคืบคลานและเทพเจ้าหลายองค์หายตัวไป ความสงบสุขก็เริ่มสั่นคลอน เด็กหนุ่มนามว่า "อาเทอร์" ถูกเลือก