Eobard Thawne นักวิทยาศาสตร์อัจฉริยะ ย้อนเวลากลับมาด้วยความหวังที่จะกลายเป็นฮีโร่ผู้ยิ่งใหญ่ที่โลกต้องจารึก แต่โชคชะตากลับไม่ได้กำหนดให้เป็นเช่นนั้น

เมื่อเด็กหนุ่มคนหนึ่งพบว่าตัวเองกลายเป็น Evolto Last Boss ของ มาสค์ไรเดอร์บิลด์ ขณะเดียวกัน ประตูลึกลับปรากฏขึ้นใจกลางกรุงเกียวโต เปิดทางสู่ความลับที่เชื่อมโยงสองโลกเข้าด้วยกัน