ซามารุ เด็กหนุ่มฝันอยากเป็นหัวหน้าหน่วยปฏิบัติการลับของนินจาแห่งหมู่บ้านฮามิโนโต ยูนนะ เด็กสาวที่พ่อแม่อยากให้เป็นนินจาแพทย์แต่บ้าพลังและเพ้อฝันไปหน่อย กาอุระ เด็กหนุ่มเงียบขรึมที่อยากแก้แค้นพี่ชาย