เมื่อสึนะถูกอาจารย์ผู้เป็นที่รัก(?)ส่ง(ถีบ)มาเรียนที่ราคุซันและส่งผู้พิทักษ์คนอื่นๆก็ถูกส่งไปตามโรงเรียนต่างๆ สึนะมาอาศัยอยู่กับอาคาชิผู้เป็นเพื่อนสมัยเด็ก แล้วเหตุการณ์ต่างๆจะเป็นอย่างไรมาดูกัน

เกิดเหตุการณ์ไม่คาดฝันทำให้พวกโคนันต้องย้ายมาเรียนที่นามิโมริและเข้าไปยุ่งเกี่ยวกับพวกสึนะเรื่องยุ่งๆจึงเกิดขึ้น

เมื่อสึนะถูกวองโกเล่หักหลัง สึนะไปที่โลกของนารูโตะ ซึ่งมันไม่ใช่ปัญหาของสึนะเนื่องจากสึนะเคยมาที่นี้แล้ว และสึนะก็ได้เจอกับเพื่อนสมัยเด็กอย่างกาอาระและนารูโตะซาสึเกะและคนอื่นๆอีกมากมาย