คิระ ยามาโตะ ชายหนุ่งอัจฉริยะที่โดนไล่ออกจากงานเลยมาใช้ชีวิตที่เกาะแห่งนึ่งที่เป็นมรดกของคุณปู่ของเขาที่เหลือทิ้งไว้ให้โดยที่เขาไม่รู้ตัวเลยว่าชีวิตของเขากำลังจะเปลี่ยนไปตลอดกาล

ชายหนุ่มที่เกิดมาจากมนุษย์และคันเซนมีความสามารถที่ใกล้เคียงกับเหล่าสาวเรือรบคันเซนแต่เขาไม่สามารถรวมร่างกับเรือรบของตัวเองได้แต่เขากับได้รับพลังที่อาจจะเหนือกว่าพลังที่สามารถเปลี่ยนแปลงโลกได้