สงครามจอกศักดิ์สิทธ์ได้เริ่มต้นอีกครั้งในโลกแห่งนี้ ทว่ากลับมีผู้แทรกแซงจากโลกดิจิตอล โทซากะ ริน มาสเตอร์ของสงครามได้ถูกลูกหลงของการแทรกแซง และ ถูกดูดเข้าไปในโลกดิจิตอลที่มาพร้อมการพจญภัยสุดแสนประหลาด

ในโลกแห่งความเร็วแห่งนี้นั้นเกิดเหตุการณ์สุดสะเทือนใจนั้นคือ หนึ่งในราชาสีบริสุทธิ์ทั้ง 7 เกิดการทรยศจนไปสู่การสูญหายของผู้ทรยศ และ การตายของหนึ่งในนั้น นับตั้งแต่นั้นราชาสีก็เกิดการบาดหมางกันมาตลอด

เมื่อการทะเลาะกันของเพื่อนสนิท นำไปสู่ความปั่นป่วนของมัลติเวิร์ส ที่พวกเขาทั้งคู่กำลังทำ ระหว่าง Black Rock Shooter ปะทะ Black Gold Saw ความปั่นป่วนระดับมหาภัยกำลังเริ่มต้นขี้น