เรื่องราวหลังจากจบศึกกับองค์กรชุดดำ 'คุโด้ ชินอิจิ' และ ไอบาระ ไอ' ยังไม่กลับคืนร่างเดิม หลังจากที่ชินอิจิเจอรันอยู่ทุกวันเขากลับรู้สึกว่าความรู้สึกของเค้านั้นไม่เหมือนเดิม